Next-Generation-Sequencing

Next-Generation-Sequencing (NGS) ist eine Hochdurchsatz-Sequenziertechnologie, die eine parallele Analyse von DNA- oder RNA-Sequenzen ermöglicht. Im Gegensatz zur klassischen Sanger-Sequenzierung erlaubt NGS die gleichzeitige Sequenzierung von Millionen von Fragmenten, wodurch Mutationen, Genfusionen, Amplifikationen und Expressionsmuster effizient erfasst werden können.

Methoden und Ansätze

• Whole-Genome-Sequencing (WGS): Sequenzierung des gesamten Genoms.
• Whole-Exome-Sequencing (WES): Analyse der proteinkodierenden Regionen (~1 % des Genoms).
• Targeted Sequencing: Fokussierte Untersuchung spezifischer Gene oder Genpanels.
• RNA-Sequencing (RNA-Seq): Erfassung der Genexpression und Fusionstranskripte.

Pathologische Relevanz

• Onkologie: Erkennung von somatischen Mutationen, Treibermutationen (z. B. EGFR, KRAS, PIK3CA) und Tumormutationslast (TMB).
• Erbkrankheiten: Identifikation monogener Erkrankungen.
• Infektionsdiagnostik: Detektion viraler und bakterieller Pathogene.

Diagnostik

• NGS wird in der personalisierten Medizin zur gezielten Therapieentscheidung genutzt.
• Analysen erfolgen aus Tumorgewebe oder zirkulierender Tumor-DNA (ctDNA).

Therapeutische Relevanz

• Identifikation therapierelevanter Mutationen für zielgerichtete Inhibitoren.
• Prädiktion des Ansprechens auf Immun-Checkpoint-Inhibitoren durch Bestimmung der TMB.